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霉菌儲糧水分的高低是霉菌生長的重要決定因素，也是糧食儲藏過程中發生霉變的主要原因。糧食入庫時需嚴格控制含水量，曬干入庫，種子的含水量不宜超過15%；在倉庫內放置無水氯化鈣、草木灰等降低空氣濕度，將相對濕度降低到60%以下；糧倉等設備建好防潮地坪和防潮墻以隔離濕氣。此外，混在糧食中的各種雜質、破損粒和不成熟粒等往往攜帶大量的微生物，一般1g糧食含微生物4000多個，而1g雜質含微生物高達50000多個。新糧入倉前利用風車和清理篩等清除混在糧食中的各種雜質，保持糧食清潔衛生和糧粒完整。糧食入倉前利用乙醇、次氯酸鈣、次、二氧化氯和氧化氫等消毒劑對倉儲設施進行消毒處理，殺滅霉菌。
有機糧食倉儲對策建議我國有機糧食產業發展迅猛，儲糧是產業發展的重要環節，制定有機糧食的有機倉儲方式以及儲糧有害生物的有機防治方法意義重大。基于儲糧有害生物的生活習性，在糧食收獲到入倉的全過程中提出了阻擋、驅避、殺滅等控制方法，同時考慮有害生物賴以生存的溫度、水分、空氣等因素，針對性地提出了有機糧食的倉儲方式，對于生產企業技術方案的制定以及認證標準的建立具有指導意義，但這些倉儲方式需要因地制宜做出調整，尚需根據實踐加以改進和完善。
氣調儲藏技術為了解決化學藥熏蒸所造成的問題，氣調技術作為一種環保，安全，有效的儲藏方式逐漸代替了等化學藥熏蒸法，它有不使用化學藥就可達到滅蟲防霉，減緩糧食品質劣變和避免環境污染、害蟲抗藥性產生等優點。充氮氣在對充氮氣調儲藏和常規儲存的玉米品質進行了比較研究，結果顯示，低溫時，兩種方式儲藏的玉米品質無明顯差異，在20℃儲藏6個月，玉米發芽率由96％分別降低至87％、85％，脂肪酸值由22.4（KOH／干基）／（mg／100g）分別增長至45.9（KOH／干基）／（ｍｇ／100g）、47.4（KOH／干基）／（mg／100g）；在高溫35℃儲藏６個月，玉米的發芽率分別降低至42％、8％，脂肪酸值分別增長至49.5（KOH／干基）／（mg／100g）、57.6（KOH／干基）／（mg／100g），充氮氣調儲存的玉米品質指標變化程度都要比常規儲藏小，氣調儲藏利于玉米儲藏。
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